摩托车合格证丢了是可以补办的。摩托车合格证是由生产厂颁发的，如果丢失了，应该向生产厂联系，请求补办合格证。机动车上路行驶的基本条件之一就是需要车辆的合格证，如果车辆的合格证丢失，那么上路就是属于违规行为。
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