法律分析：由其投资者或相关人员承担偿还责任。公司未经合法清算，工商行政管理部门即办理了注销登记，在这种情况下，公司只要办理了注销登记，即不能作为民事主体承担民事责任了。公司如果不是经破产程序终止，就可以推定该公司法人在被注销前的财产足以清偿债务，而该公司法人的债务没有清偿即被注销，可以推定该公司法人用于清偿债务的财产被其投资者或相关人员占有，故应由其投资者或相关人员承担偿还责任。公司注销，其民事主体资格即消灭，正常情况下，本不存在也无法追究其民事责任。但如果存在其他当事人如股东、董事、监事、经理等应对该公司债务承担责任的情形，则可以以其他当事人为被告，直接对其追究相应的民事责任。
法律依据：《中华人民共和国企业破产法》 第一百一十三条 破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，依照下列顺序清偿：（一）破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金；（二）破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款；（三）普通破产债权。破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的，按照比例分配。破产企业的董事、监事和高级管理人员的工资按照该企业职工的平均工资计算。
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