仲裁机构能确认无争议合同的效力。仲裁庭有权确认合同的效力，但向仲裁委员会申请仲裁的，应当有仲裁协议，表明请求仲裁的意思表示，约定仲裁事项和选定的仲裁委员会。
【法律依据】
《中华人民共和国仲裁法》第二条
平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。
第四条
当事人采用仲裁方式解决纠纷，应当双方自愿，达成仲裁协议。没有仲裁协议，一方申请仲裁的，仲裁委员会不予受理。
第十九条
仲裁协议独立存在，合同的变更、解除、终止或者无效，不影响仲裁协议的效力。仲裁庭有权确认合同的效力。
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