互联网灰色产业链对知识产权保护和创新发展造成了多方面的影响。首先，灰色产业链往往涉及侵犯知识产权的行为，例如盗版、侵权等，导致正版产品的销售受到影响，降低了创新动力，影响了知识产权的保护。其次，灰色产业链的存在使得创新成果很容易被模仿和复制，降低了企业进行创新的积极性，进而影响了整个产业的创新发展。此外，灰色产业链还会对市场竞争环境产生不正当的竞争行为，破坏了公平竞争的秩序，对创新型企业造成不正当竞争的困扰，影响了创新的发展。
为了应对这些问题，管理者可以采取一系列措施。首先，加强相关法律法规的制定和执行，加大对灰色产业链的打击力度，提高侵权成本，增加违法成本，使侵权者付出更大的代价。其次，加强知识产权的保护，鼓励企业加强自身知识产权的保护意识，加强专利、商标等知识产权的申请和维护工作，提高企业的技术壁垒，以保护自身的创新成果。此外，加强行业自律，建立行业联盟或协会，共同维护行业的创新环境，抵制灰色产业链的侵害行为。
在实际案例中，可以借鉴一些企业采取的措施。比如，一些知识产权保护严密的企业，通过技术手段对产品进行加密保护，加大了对产品的控制力度，减少了盗版行为。另外，一些行业协会也会组织行业内的企业共同开展知识产权保护宣传活动，加强行业的自律管理，共同维护行业的创新环境。