在互联网灰色产业链中，企业可以采取以下措施保护自身利益和声誉：
建立合规机制：企业应建立完善的合规机制，包括制定严格的合规政策、加强内部监管和审计，确保企业内部不参与灰色产业链。
加强供应链管理：对供应商进行严格的审核和管理，选择有信誉和合规经营的合作伙伴，避免与灰色产业链相关的供应商合作。
维护知识产权：加强知识产权保护，包括申请专利、商标等知识产权，及时发现侵权行为并采取法律手段维护自身权益。
利用技术手段：利用技术手段监控和防范灰色产业链的侵害，例如利用大数据分析、人工智能等技术手段，及时发现和应对灰色产业链的风险。
提升消费者教育：加强对消费者的教育和宣传，提高消费者对灰色产业链的辨识能力，增强消费者的维权意识。
案例：阿里巴巴集团通过建立完善的知识产权保护体系和技术手段，有效应对了平台上的灰色产业链问题，保护了企业和消费者的利益。
综上所述，企业在互联网灰色产业链中保护自身利益和声誉，需要建立合规机制、加强供应链管理、维护知识产权、利用技术手段和提升消费者教育等多方面的综合措施。