GEO数据库的搜索下载数据技巧
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发布时间：2024-10-23 20:54
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时间：2024-11-01 08:15
GEO数据库，即GENE EXPRESSION OMNIBUS，是由NCBI创建的全球基因表达数据仓库。创建于2000年，它收纳了全球科研机构公开的高通量基因表达数据，无论论文是否发表，只要涉及的基因表达数据，GEO都能为你提供查找途径。
访问GEO有两条主要路径：一是通过GSE编号，直接在ncbi.nlm.nih.gov/geo输入编号，详情可参考omicsclass.com/article/...；二是通过NCBI主页，搜索“GEO DataSets”，或者按基因表达量查找GEO Profiles，通过样品类型、实验处理和平台信息筛选数据。
在搜索过程中，理解界面元素至关重要。GEO界面与PubMed类似，包括检索框、结果列表、选项设定和检索记录。数据类型选择要根据需要，如常用的是series数据集。检索条件要精细，包括数据类型、实验平台、作者、物种来源和样品类型等，确保找到符合需求的数据。
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